南通瑞慈医院始建于 2000 年，是集医疗、教学、科研一体的三级乙等综合性医院，定位“家门口的上海医院”，被誉为“中国医卫改革的样本”。医院是扬州大学附属医院，南通经济技术开发区区域医疗中心，开发区医联体牵头单位，建有120急救分站。 2025 年与同济大学附属东方医院签约, “上海市东方医院南通瑞慈医院”揭牌。医院“十五五”规划，以综合医院为核心、康复和护理为两翼的发展格局，争创 “三甲”，致力建设“医康养特”一体化的标杆医院。
医院环境优美，占地面积 13 万平方米。院区内，综合医院、健康体检、特需医疗、母婴护理中心、康复医院、美邸护理院等特色机构，构建起“医康养特”的全生命周期健康服务体系。规划总床位2000张，其中医疗1000张、康复350张、护理550张、特需床位100张。设 34 个临床医技科室、26 个病区。配备 PET-CT、伽马刀、3.0T 核磁共振、直线加速器、DSA等精密诊疗设备。拥有入选省“333”、市“226”高层次人才、 市江海英才，国家、省、市级学术专委会副主委及学组组长以上约70人。
医院学科综合实力雄厚，以心血管中心、脑血管中心、肿瘤中心三大核心科室为特色，同步打造胆石、房颤等特色专病中心。标准化建成胸痛中心、卒中中心、创伤中心三大急救中心，为区域群众急危重症救治提供坚实保障。医院重点专科建设项目8个，涵盖普外科、心血管内科、心胸外科、神经内科、麻醉科、儿科、妇科、影像科等科室。陆续成立“胡海名医工作室”（胆石）、“杨兵名医工作室”（房颤）等上海特色专病工作室，推动了医院诊疗水平的再升级。
未来，医院将坚持“一体两翼”，持续深化医康养特融合发展，致力于打造辐射苏中苏北的区域医疗新高地，为广大群众提供优质、便捷、专业化的全生命周期综合医疗服务。